1、区政府投资审计中心

机构职能：承担对区级公共投资建设领域重要事项开展审计或审计调查的辅助工作；承担对重点投资项目和民生工程开展跟踪审计的辅助工作；承担对公共投资建设资金运用情况开展绩效审计的辅助工作；承担参审社会中介机构选聘、管理、考核等的辅助工作；承担投资审计领域信息化建设的事务性工作；完成区审计局交办的其他任务。
2、区经济责任审计中心
机构职责：承担行政事业单位领导干部任期经济责任审计的辅助工作；承担区属国有企业、国有资本占控股或主导地位企业领导干部任期经济责任审计的辅助工作；承担自然资源资产审计的辅助工作；承担预算执行和其他财政支出情况审计的辅助工作；承担政策跟踪审计的辅助工作；承担指导区直部门、单位内部审计的辅助工作，推动建立健全内部审计工作体制机制；承担审计业务电子数据的发展规划、审计信息化建设和管理、网络安全以及审计业务电子数据采集、验收、整理和综合分析利用等技术性、事务性工作；完成区审计局交办的其他任务。