羟甲芬太尼——一种新的高选择性u阿片受体激动剂获得1991年国家自然科学二等奖，图为羟甲芬太尼课题组进行学术讨论

Smithkline Beecham Phamaceuticals -上海药物所 签订组合化学合作协议(1997年)

1990 年代，药理二室

1990年4月，新药研究开放实验室论证会，被列入科学院重点实验室之一

1991年11月，美国洛氏基金会南南协作组工作例会部分代表

1995年6月27日至29日，新药研究国家重点实验室建设验收检查组及验收专家委员会对实验室的工作进行现场检查和评议

2000年7月，在上海药物所南湖工作会议

2002年4月，“知识创新工程”重大项目《创新药物研究开发与药物创新体系建设》经过专家论证、院党组批准立项实施

2003年，上海药物所整体迁址浦东新区祖冲之路555号