孜珠寺位于西藏东部昌都地区丁青县著名的神山-----孜珠山上，海拔4800米左右，是西藏海拔最高的寺院之一，也是雍仲苯教最古老、最重要的寺庙之一。孜珠寺始建于三千年前，由第二代藏王穆赤赞普倡导，大成就者第一世穆邦萨东大师创建并传承，已是第四十三世。住持喇嘛被尊称为“孜珠活佛”，现任住持为丁真祖普俄色活佛。

辛绕佛祖曾预言：当后世无量光佛像、左旋白法螺与具格的贤者在孜珠山汇聚，即是我的身语意三宝具足，孜珠山佛法的火种将大放光芒，照亮世界。

苯教有四大神山之说，主要有阿里的岗底斯山、林芝的本日神山，昌都的孜珠山、德钦的梅里雪山。六座山峰上到处是大殿、经堂、僧舍，繁盛时期僧人多达二、三千人。佛祖辛绕弥沃在弘扬佛法时，曾在孜珠山传法，给予巨大的加持。并且授记，今后孜珠山会对苯教佛法的发展和传播有着深远的影响，会有许多利益众生的大成就者出现。此后历代在神山修行者中涌现出了80位大成就者，并留下了他们的珍贵遗迹。如有辛美祖普、东炯大师、占巴南喀大师、才旺仁曾大师、罗丹尼布大师、桑杰林巴大师等，以及他们和莲花生大师修行的山洞，并在石壁上留下了手印和脚印。孜珠山的圣迹比比皆是，岩壁和洞穴里自显的佛像、坛城、真言，令人目不暇接，它将如此丰富的本教宝藏集于一山。同时孜珠山也有代表六道轮回的绕山隧道，许多藏民虔诚的不远千里来此朝拜。