知识的价值不在于占有,而在于使用。

生信自学网-速科生物-生物信息学数据库挖掘视频教程

当前位置: 主页 > TCGA >

如何绘制生存状态图

时间:2020-09-08 20:39来源:生信自学网 作者:刘鑫 点击:
上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。

绘制生存状态图

上一篇文章我们介绍了如何绘制风险热图和风险曲线图,这一次我们教大家绘制最后一张生存状态图。
 

我们先来看一下我们要得到的生存状态图

 
生存状态图,它的横坐标和前面我们提到的两张图是一样的,也是将病人按照风险值由低到高排序。排序好了之后,我们就把病人的生存时间标上去,也就是说我们这里的纵坐标就是病人的生存时间,然后我们也会把这个病人的生存状态通过不同颜色的点标上去,红色的点它代表病人已经死亡,绿色的点就代表这个病人还存活着。
所以从这个图里面我们可以看到随着这个风险值的增大,死亡的病例越来越多,然后同时我们也可以看到生存时间,左边的生存时间相对于右边来说要高一些,随之风险的增大,生存时间也就降低了,死亡的人数也就增加了。
 
下面我们来绘制这个图形,绘制这个图形的输入文件和前一篇文章讲的一样,也是risk.txt文件,脚本文件的话是我们自己准备好的文件,大家可以通过购买我们的课程获得该套课程的学习视频和脚本文件。
 


通过R运行我们的脚本文件,我们就可以得到我们需要的生存状态图了。


课程链接:
TCGA数据库批量挖掘lncRNA视频

相关课程:
长非编码RNA芯片数据挖掘视频



加生信自学网群
责任编辑:伏泽
作者申明:本文版权属于生信自学网(微信号:18520221056)未经授权,一律禁止转载!
BioWolf二维码生成器
------分隔线----------------------------
  • 上一篇: 如何绘制风险热图和风险曲线
  • 下一篇: 共表达预测lncRNA靶基因
  • 收藏
  • 挑错
  • 推荐
  • 打印
GEO芯片数据库挖掘生信视频教程
推荐内容
  • 癌症相关成纤维细胞CAF生信套路(

    癌症相关成纤维细胞CAF生信套路...

  • 免疫细胞浸润与免疫细胞的相关性

    1、免疫细胞浸润 2、免疫细胞的相关性...

  • 如何下载基因集文件

    这里教大家如何在GSEA上下载GO的数据集。...

  • 肿瘤干细胞临床数据的下载及整理

    临床数据的下载及整理...

  • 肿瘤干细胞文章套路视频课程

    肿瘤干细胞(Cancer Stem Cell, CSC),是指肿瘤中具有自我更新能力并能...

  • 绘制气泡图

    免疫基因对最后一节教大家如何绘制GSEA富集结果的气泡图...

热点内容
  • KEGG通路富集分析
  • 癌症类型和样本代号详解
  • 7种可变剪接类型(TCGA可变
  • GO与KEGG富集分析
  • TCGA下载和提取临床数据
  • TCGA数据库Counts和FPKM以及
  • TCGA数据库完整临床数据全
  • GEO、TCGA、Oncomine应该选择
  • GO功能富集分析
  • 运行生信自学网perl脚本报
TCGA数据库挖掘文章套路生信视频教程
中药复方网络药理学文章套路生信视频教程