从军衔上来说军种和战区司令都是上将或中将，属于平级。只是职责、功能各有不同，也就是所谓军种主建、战区主战。军种主建，主要建设的是战斗力。作战、保障人员的训练和管理，武器装备、保障装备的提供和提升等；战区主战，主要根据新划定的区域，负责指挥所辖部队执行作战或防卫任务。
按照以上功能划分，军种和战区应为相辅相成的协作关系，与作战有关的部队调动等由战区指挥机关负责，与部队训练、人员管理、人才建设、武器装备保障等有关的事项由军种负责。
陆军司令属于军种司令，军种司令管平时，战区司令管战时。非战时部队训练、装备建设由各军种负责，预算和计划由司令部下达到各部队，具体执行则有战区负责。打仗时就是战区司令负责了，军种司令不参与具体作战指挥的。
部队还是在各军中司令员的手里，备战时由兵种司令员分配军队到各战区司令，比如有一个任务，军种司令员认为只需要一个团的兵力，那么战区司令只能得到一个团的兵力。
各战区设立战区军种司令员（有5位，归各自的军种总司令管。）与战区司令员是合作关系，因为人事权不在战区司令的手里，在军种司令员手里，最终在军委主席手里。
总结就是，军种司令员是国家级别的，战区军种司令员是地方级的，战区司令员是地方级的老大，和国家级不在一个层面上。战区陆军司令是副大军区级别，中将军衔。
战区属于正大军区级别，战区司令、政委主要是上将军衔；副司令、副政委、参谋长属于正大军区副职，中将军衔。至于战区陆军属于副大军区，陆军司令员、政委属于副大军区正职，中将军衔，与战区副司令、副政委、参谋长军衔相同。