福建省福州经济技术开发区于1985年1月经国务院批准成立，是全国首批14个经济技术开发区之一。福州经济技术开发区集国家 级高新区、福州新区核心区、台商投资区、保税区、出口加工区为一体；拥有国家新型工业化产业示范基地（电子信息·物联网）、国家生态工业示范园区、国家自主创新示范区、国家 级生态区、国家显示器件产业园、国家科技兴贸出口创新基地和福建省服务外包产业园等称号。

1993年1月1日起，福州经济技术开发区和福州市马尾区两区合一，实行两块牌子、一套行政机构。

2014年12月12日，国务院批准成立福建自由贸易试验区，其中，福州经济技术开发区22平方公里纳入福建自由贸易试验区福州片区总规划范围，肩负着建立符合国际惯例的投资贸易管理新体制，加快形成更高水平的对外开放新格局、拓展与“海丝”沿线国家和地区的投资贸易交流合作、创新两岸合作机制，打造两岸共同参与国际合作竞争的新平台的重要使命。

2015年8月30日，国务院批准成立福州新区，作为福州新区的核心区，福州经济技术开发区的开发和建设上升为国家战略，将建成两岸交流合作重要承载区，扩大对外开放重要门户、东南沿海重要现代产业基地、改革创新示范区和生态文明先行区。

目前，福州开发区是福州新区、自贸试验区、海丝核心区、生态文明先行示范区、自主创新示范区等多个国家战略层面政策叠加的重要区域。未来，福州经济技术开发区将强化两岸在高新产业、服务贸易、海洋经济以及21世纪海上丝绸之路方面的交流合作，加强两岸金融业务创新，同时依托“两马”交流、船政文化等对台人文交流优势，促进两岸旅游、人文深度融合，重点建设两岸高新产业合作基地、“海丝”合作前沿平台，以及两岸现代服务业和金融创新合作试验区。

福州经济技术开发区22平方公里纳入自贸区福州片区：快安片区5.6平方公里、马江片区4.4平方公里（含福州保税区块0.6平方公里）、长安片区5平方公里（含福州出口加工区1.14平方公里）、琅岐片区2平方公里，以及南台岛片区5平方公里。

福州经济开发区依港兴区，马尾港是千年古港，为国家一类开放口岸，对台直航码头，港区蕞大停泊能力为3万吨，年集装箱吞吐量在100万标准箱以上，港区内的疏港铁路与国家铁路网相连，方便货物集散，是福州港的主要货物集散中心，区内海关、国检、边检、海事等口岸查验单位配套完整，直航包括台湾、香港、韩国、日本在内的30多个国家和地区；104国道、沈海高速穿区而过，距福州火车站、火车南站仅20分钟车程，距福州长乐国际机场仅25分钟车程，得天独厚的水、陆、空大交通枢纽体系，便于货物的分拨和人员的往来，吸引八方客商来区兴业。